Arquivos em Flash são um recurso realmente interessante para quem cria sites.
Os arquivos em Flash podem ser muito elaborados, e é comprovado que eles realmente chamam a atenção dos visitantes do seu site.
Porém você deve usar este recurso com moderação. Os sites não devem ser feitos totalmente em Flash, e o conteúdo do Flash não pode ser essencial ao seu site.
Estas limitações tem como principal justificativa o fato de que a maioria dos sites buscadores, como Google, MSN, etc, não lidam muito bem com Flash.
É muito provável que estes sites não consigam indexar o conteúdo dos arquivos Flash do seu site, e isto pode se tornar um problema se o nome do seu produto aparece somente em Flash, por exemplo.
O uso indicado de arquivos Flash é em banners, para chamar a atenção do visitante a um aspecto importante do seu site, em elementos visuais puramente decorativos, ou quando é necessária uma interatividade maior com o visitante que não é possível de outra forma, como por exemplo, jogos em Flash.